Uno de los ámbitos abarcados por esta ingeniería son los cultivos celulares, de los cuales se sabe que tienen una serie de ventajas innegables, pero al mismo tiempo tienen desventajas que hay que tener en consideración ; tal es el caso de la cantidad y costo de producción en estos cultivos, pues el costo de producción de 1g. De tejido en cultivo es más de 10 veces superior al obtenido en el cuerpo en cuestión. Asimismo existe una limitación de producción que es del orden de 10 g. de células en un laboratorio normal, y que para ser superior a 100 g requiere de instalaciones de tipo industrial y personal altamente capacitado lo que trae de la mano el aumento notorio de costo.
Otro punto que cabe destacar en cuanto a los cultivos celulares, es la inestabilidad celular de ellos, pues muchas de las líneas celulares continuas suelen no ser precisamente duradero o constante, esto como consecuencia de la dotación cromosómica aneuploide. La población celular puede variar su composición si alguna de las subpoblaciones celulares es capaz de crecer con una tasa ligeramente superior, es decir podemos encontrar diferencias significativas en la línea celular de una generación a la siguiente.
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